ブラストクラスとを使う時のメモ
DNA配列をクラスタリングする時の例
blastclust -i filename.txt -p F -S 95 -L 0.7 -o outfilename.txt -e F
-i filename.txt 入力ファイル名（ＦＡＳＴＡファイル）
-p F タンパク質かそうでないか。Ｔ＝タンパク質 Ｆ＝ＤＮＡ （これは忘れがち。デフォルトでタンパク質になっている。）
-S thresholdのスコア。３以上だと％ ３以下だとscore/length
-L thresholdの長さ。アライメントされる配列はどれくらいの長さが必要か。
-e フォーマットが必要か。これをＦにしないとうまくいかない？
DNA配列をクラスタリングする時の例
blastclust -i filename.txt -p F -S 95 -L 0.7 -o outfilename.txt -e F
-i filename.txt 入力ファイル名（ＦＡＳＴＡファイル）
-p F タンパク質かそうでないか。Ｔ＝タンパク質 Ｆ＝ＤＮＡ （これは忘れがち。デフォルトでタンパク質になっている。）
-S thresholdのスコア。３以上だと％ ３以下だとscore/length
-L thresholdの長さ。アライメントされる配列はどれくらいの長さが必要か。
-e フォーマットが必要か。これをＦにしないとうまくいかない？
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コメント
べっ、べつに
べっ、べつにあんたなんかに興味は無いんだからね！(人･ω･)♪ http://gffz.biz/index.html
posted by 名無しat 2011/12/12 05:25 [ コメントを修正する ]
