MJさむらいの実験室

A post-transcriptional regulatory switch in polypyrimidine tract-binding proteins reprograms alternative splicing in developing neurons.
Genes Dev. 2007 Jul 1;21(13):1636-52.
Boutz PL, Stoilov P, Li Q, Lin CH, Chawla G, Ostrow K, Shiue L, Ares M Jr, Black DL.

この論文は神経特異的なアルターネーティブスプライシングの仕組みを調べている論文です。
明日研究室のセミナーで論文紹介をするのにこの論文が面白いかなと思ってます。
ちょっとややこしいですけど、polypyrimidine tract-binding proteinがアルターネーティブスプライシングを神経で特異的に起こるように調節している論文です。

この論文を詳しく読んで、今日のセミナーで紹介しました。
アルターネーティブスプライシングを調節をしているpolypyrimidine tract-binding protein自身がアルターネーティブスプライシングをしているというちょっとややこしい論文でした。

ＰＴＢは神経細胞に分化した細胞には発現しないのですが、ｎＰＴＢが発現するようになるらしいです。
タンパク質レベルでは非常に綺麗にｎＰＴＢの発現が神経細胞特異的にみられます。

しかし、ｎＰＴＢのｍＲＮＡが神経細胞以外にもでている。
これが、スプライシングを受けてタンパク質をつくりだせないゴミのｍＲＮＡじゃないかという事で調べるのですが。。。。。
Nonesense mediated decayという経路で分解されるからじゃないかと調べるのですが、
ｍＲＮＡが検出できているので分解されているわけではないのでどうも怪しい。

確かに論文中には他の経路で転写後調節がされているという事が強調されてましたが。

Nonesense mediated decayが原因だったらｍＲＮＡはなくなっているはずじゃないかと思ってしまう。
（理解できてないだけなのか？もうちょっとNonesense mediated decayに関する実験例の知識がないとわからない。論文あるのか？）

後はｎＰＴＢがＰＴＢによってタンパク質の発現が抑えられていること。

ｎＰＴＢやＰＴＢをノックダウンした時にアルターネーティブスプライシングに与える影響が、
exonを得るパターンも失うパターンも両方ある。

しかし、メカニズムは良く分かってない。（シススプライシングの抑制だけではないようだ）

神経細胞でｎＰＴＢのタンパク質は綺麗に特異的に発現していて、それはエクソン１０を持つパターンのｍＲＮＡが増える事でおこるようです。

現象は非常にクリアーなんですが、結局のところｍＲＮＡの発現とタンパクの発現の関係がわからない。もっといろいろ制御が隠れているという事なんだろうけど、アルターネーティブスプライシングはそれほど神経細胞特異的に劇的に起こっているわけでもなさそう。

この論文は実験もたくさんやっていて、結果もすごく出しているし、いろいろ試行錯誤してやっていていい論文だと思った。
意外と転写後調節で何かしら分かってない調節が起こっるんだなあ、というのが感想です。