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2017/12/11 18:14 |
SLトランススプライシングからシススプライシングに変えれるのか
Conversion of a trans-spliced C.elegans gene into a conventional gene by introduction of a splice donor site
Richard Conrad, Ruey Fen Liou and Thomas Blumenthal
The EMBO Journal vol.12 no.3 1249-1255, 1993

SLトランススプライシングの5'上流にエクソンのドナーサイトを挿入すると、
SLトランススプライシングがシススプライシングに変わるのかという事を調べている論文。

しかし、なんとも読みにくい。
図が書いてあるのだが、その図をフォローするのがかなり難しい。
こういう論文はなんとも眠くなってしまうのだが、自分が行おうとしている実験と似ているので
何とかすべての実験をフォローしておかなくては。

また、最近のトランススプライシングに関する自分のアイデアが本当に正しいかどうか、
という視点から
この論文の実験の結果を解釈してみたい。


アウトロン(outron)にシススプライシングのドナーサイトを挿入した。
その結果、SLトランススプライシングの代わりにシススプラシングが誘導できたというのが主な実験結果。

SLトランススプライシングはシススプライシングと同じメカニズムで起きているだろうということを示唆している。

その際、すべてのmRNAがシススプライシングされたわけではなくて、SLトランススプライシングも同時に起きてしまった。しかし、より、トランススプライシングのアクセプターサイトの近くにドナーサイトを挿入したほうが効率よくシススプライシングが起きた。

なぜこのようなことがおきるのか、ぼくの考えている理屈に当てはめて考えると納得がいく解釈ができる。
が、この論文の中では良い解釈が見つかっていないようだ。

この後の実験で、イントロンの長さが関係しているのではないかと考えて、
イントロンの部分を長くしたらどうなるかと言うことを試している。
しかし、長くしても人工的なシスプライシングの効率は変わらないと言う結果にがでて、その後の解釈に苦労している。
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2007/08/10 01:30 | Comments(0) | TrackBack(0) | 論文から

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