忍者ブログ
[PR]
×

[PR]上記の広告は3ヶ月以上新規記事投稿のないブログに表示されています。新しい記事を書く事で広告が消えます。


2018/10/18 10:46 |
pyrosequencing(454シークエンス)の説明1
454ex1.jpg


454のホームページや論文を読んだら書いてあるのですが、
信じられない発想なので理解しがたいと思いますので日本語で説明します。
Margulies et al., 2005, Nature, 437, 376-380
http://www.454.com/index.asp

そもそも454シークエンサーはゲノムを一度に多量にシークエンスするために開発されました。
一度にというのは、一回のランでという事です。
ぶつぶつに切ったゲノムDNAをサンプルにしてランダムに読むのですが、
一度のランで300,000readsも得る事ができます。
しかし、各READSは平均120bpと短いです。

上の写真をクリックすると拡大できるので見てください。
ゲノムをブツブツにきります。シアーリングといって、物理的にきります。
この論文では、DNAを混ぜた液体で霧を作ることで、DNAを小さな断片にしました。

各DNA断片の端にAとBのアダプターをつけます。Bのアダプターがついたほうがシークエンスが始まる側になります。

一番右側の図はどうやってアダプターをつけるかという説明の図ですが、ややこしいので説明はしませんが、
ビオチンをつかってうまくAとBのアダプター対になっているシングルストランドの断片だけを抽出する方法です。詳しくは論文のサプリメンタルデーターで。
PR

2007/08/13 23:46 | Comments(0) | TrackBack(0) | 何かの簡単な説明

トラックバック

トラックバックURL:

コメント

コメントを投稿する






Vodafone絵文字 i-mode絵文字 Ezweb絵文字 (絵文字)



<<454シークエンス説明2 | HOME | 無理だと思います。>>
サンカラショッピングモール / ダイエット / ビューティー・美容 / 布団・寝具 / 日用品・雑貨 / 家電製品 / 健康・ヘルスケア / 食べ物 / 飲み物 / アクセサリー / 時計 / ファッション / ブランド / ペット用品 / コスプレ / もしもの人気商品100選 / 新着さんから100 / 送料無料ショップ / もちもちロール / 送料無料ショップ / emsダイエット / ホットシャワー3 /
忍者ブログ[PR]