右側がシークエンサーです。
このシークエンサーは、まったく働き方が従来のサンガー法とは違います。
アデニン、（洗い）、チミン、（洗い）、グアニン、（洗い）、シトシン、（洗い）と順番にサンプルに流していくのです。
もし、流した塩基がビーズの一本鎖ＤＮＡにポリメレースによって結合反応すると、ルシフェラーゼによって光ります。その光を取り込むことによって、各ビーズの塩基配列を読み取っていくのです。
反応が起こる仕組みは、ポリメレースのＤＮＡの伸長反応の際にでてくる燐酸が使われます。
Sulfurylaseが基質のＡＳＰをＡＴＰに変えます。そのＡＴＰを使ってルシフェラーゼが反応して光を発します。
この仕組みでは、同一塩基が並んでいたら読むのが難しくなります。なぜなら、何個塩基が並んでいるかを光の強さで読み取らないといけないからです。しかし、７塩基くらいまでなら大丈夫のようです。ホモポリマーが７塩基よりも長いシークエンスでは正確でない可能性がかなり高くなります。
参考
Margulies et al., 2005, Ｎａｔｕｒｅ, 437, 376-380
http://www.454.com/index.asp
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